Näitä negatiivisia ioneja tavataan luonnossa vesiputousten läheisyydessä ja ukkosen jälkeen. Niiden sanotaan tuottavan hyvänolon tunteen. Vastaavalla tavalla positiivisesti varautuneiden ionien uskotaan tuottavan huonoa oloa. Positiivisia ioneja voidaan havaita ilmassa juuri ennen ukkosta, kun ilma tuntuu painostavalta, ja esimerkiksi televisioiden ja tietokonemonitorien läheisyydessä.
Ionisaattoreiden hyvää oloa tuottava vaikutus lienee kuitenkin lähinnä uskomuslääketiedettä. Ionisaattorit ovat suosittuja Itä-Euroopassa ja Aasiassa, etenkin Japanissa, jossa on tapana varustaa melkeinpä jokainen sähkölaite ionisaattorilla. Useat ilmalämpöpumput valmistetaan Japanissa. Niinpä ionisaattorit ovat löytäneet tiensä myös ilmalämpöpumppuihin.
Kuitenkin on kiistämätön tosiasia, että ionisaattori puhdistaa ilmaa jonkin verran. Laite johtaa ilmamolekyylien varauksen leijuviin pöly- ja savuhiukkasiin, jotka myös varautuvat negatiivisesti. Tällöin ne kasaantuvat raskaiksi paakuiksi, jotka putoavat alas, tai vaihtoehtoisesti ne kulkeutuvat kohti neutraaleja ja positiivisesti varattuja esineitä. Ilmassa leijuvat hiukkaset kerääntyvät ionisaattorin ja sen läheisten esineiden pintaan, jotka on syytä puhdistaa.
Hiukkasten varauksien muutoksesta johtuu, että ionisaattoreita käytetään maalaamoissa poistamaan tuotteista pölyhiukkasia, ennen kuin ne peitetään maalilla. Englannin National Health Service (NHS) on tutkinut ionisaattorien käyttöä ilmassa leijuvien sairaalabakteerien torjunnassa hyvin tuloksin, ks. New Scientist-lehti.
Ionisaattoreilla on myös yksi huolestuttava piirre: teoriassa ne tuottavat vähäisessä määrin otsonia O3. Otsoni on hapen kolmiatominen muoto. Se on epästabiili molekyyli ja siten hyvä hapetin. Suurina pitoisuuksina ja väärässä paikassa tämä on pahasta. Jos ilmassa tuntuu otsonin hajua, sitä on liikaa. Otsoni saattaa vahingoittaa keuhkoja ja hajuaistielimiä.